最初宝剑骑士团的全名为“宝剑利沃尼亚兄弟骑士团”。组织架构完从上至下共分为二个等级。

第一级：贵族骑士，由参与殖民的各德意志贵族组成，每名骑士辖下数十名武装侍从；

第二级：普通侍从，包括效忠骑士团的民兵，以及服侍贵族的见习骑士和扈从。

这其中，作为骑士团之首的无疑是“宝剑骑士大团长”，拥有整个骑士团的最高权威，即是军队的总司令，又是最高行政长官。其次便是副团长、主帅、区队长、骑士等下级骑士军官。