清军主帅尼堪领轻兵，经滨州利津，直扑潍县，一举截断了济南、淄博、青州几地明军的后路，然后，在留下少量兵马驻守，清军大队不做丝毫停留，以骑兵为前导，一夜间跨过潍河，迅疾杀向掖县。

清军骑兵统领拜音图一击未克掖县后，也不做片刻停留，仅派少量骑兵监视掖县，随即引骑兵继续东向，直扑蓬莱外围门户--黄县（今山东龙口市），并于次日午前，进抵黄县，趁守军不及防备之时，夺取了一座还未来得及关闭的城门，未及半个时辰，黄县即被清军攻占。

后续跟进的尼堪领火器营和部分八旗步甲赶至掖县后，强令乌真哈超不顾城头火炮轰击，将十余门火炮推进至掖县城门，对城门进行猛烈轰击。在付出了数百名炮手的伤亡代价后，轰破城门。

掖县守军在城门附近，集聚数百火枪兵，以排枪齐射的方式，大量杀伤蜂拥攻入城中的清军步卒。

眼看着掖县守军在火枪兵的掩护下，驱使大量民壮于城门处堆砌砖石巨木，试图封堵城门。尼堪催动朝鲜鸟枪兵一千余人，冒着城头火炮和弓箭的数重打击，至城门处与明军火枪兵展开对射。

忍受巨大伤亡的朝鲜鸟枪兵数度崩溃，但在后面督阵的八旗步甲和火枪营强力弹压下，不得不几次三番地又回头冲向城门处，与明军火枪兵继续展开“排队枪毙”。最终凭借人数优势，击退了明军火枪兵，攻入城中。

被永初朝廷经营了五年之久的掖县，遂于当日晚间告破。因恼恨城中明军激烈的反抗，尼堪下令屠城，全城十余万军民尽被残杀。若不是，清军急于往东攻蓬莱，暂时放弃了对掖县周边乡镇居民的屠杀，死难民众恐会更甚。

不过，待尼堪领大军攻至蓬莱时，却撞到了铁板。几次攻城，都在蓬莱主城和几座附属堡垒的多重打击下，被守军击退，且死伤惨重，不得不暂时顿兵于城下。

既然蓬莱一时攻城不下，清军主帅尼堪遂命拜音图领骑兵，由东往西，与博洛主力大军夹击，一路扫荡身后的登莱城镇和溃乱的明军。

永宁候、登莱镇总兵蒋永锐被博洛袭了济南，一路败回青州，但清军得势不饶人，一路衔尾追击，攻势如疾风骤雨般，丝毫不给明军喘息之机。